Pépé sinh ra tại Pháp trong gia đình có nguồn gốc Bờ Biển Ngà. Anh được triệu tập vào đội tuyển Bờ Biển Ngà tháng 11 năm 2016, trong trận đấu trên sân của Maroc tại in vòng loại Giải vô địch bóng đá thế giới 2018 vào ngày 12 tháng 11. Trận này anh ngồi trên ghế dự bị và không được vào sân[3] Ba ngày sau, anh ra sân lần đầu cho đội tuyển trong trận giao hữu với Pháp trên sân Stade Bollaert-Delelis tại Lens, vào sân thay người 4 phút cuối trận thay cho Max-Alain Gradel.[4]

Pépé được huấn luyện viên Michel Dussuyer gọi vào đội hình 23 cầu thủ tham dự cúp bóng đá châu Phi 2017 tại Gabon, nhưng không được thi đấu trận nào khi những chú voi (biệt danh của đội tuyển Bờ Biển Ngà) bị loại từ vòng bảng vì chỉ xếp thứ 3.[5]

Ngày 24 tháng 3 năm 2018, trong trận giao hữu với Togo tại Pháp, Pépé ghi bàn đầu tiên cho đội tuyển trong trận hòa 2–2.[6] Anh ghi bàn thứ 2 cho đội tuyển 3 ngày sau trong trận thắng 2–1 trước Moldova cũng tại sân này.[7]